第 一 條 本規程依南投縣政府組織自治條例第九條第一項規定訂定之。
第 二 條 南投縣政府稅務局（以下簡稱本局）隸屬南投縣政府，依法辦理本縣各項稅務稽徵業務。
第 三 條 本局置局長，承縣長之命綜理局務，並指揮、監督所屬員工；置副局長一人、襄助局長處理局務。
第 四 條 本局設下列各科分別掌理有關事項：
一、服務科：掌理納稅服務、法令宣導、各項稅務稽徵抽查及內部業務檢查、研究發展、法規整檢、管制考核等事項。
二、消費稅科：掌理使用牌照稅、印花稅、娛樂稅等業務之稽徵、違章查緝、單照管理、新增地方稅企劃課徵等事項。
三、土地稅科：掌理地價稅、田賦、土地增值稅等稽徵及工程受益費之經徵等事項。
四、房屋稅科：掌理房屋稅、契稅等稽徵事項。
五、資訊科：掌理電子作業管制、系統管理、退稅人工作業、銷號及欠稅管理、稅款劃解、轉帳納稅註銷作業、機器操作及資料整理登錄、材料管理、設備及網路管理等事項。
六、法務科：掌理各稅稅務稽徵業務違章審理、國家賠償、行政救濟、稅捐保全、欠稅執行等事項。
七、行政科：掌理文書、事務、檔案、出納及其他不屬各科事項。
第 五 條 本局因應業務需要，設埔里分局及竹山分局，掌理轄區各稅稽徵等事項。
第 六 條 本局置主任秘書、科長、分局主任、視察、審核員、股長、稅務員、科員、助理稅務員、辦事員、書記。
第 七 條 本局設人事室，置主任、科員、助理員，依法辦理人事管理事項。
第 八 條 本局設會計室，置主任、科員、佐理員，依法辦理歲計、會計及統計事項。
第 九 條 本局設政風室，置主任，依法辦理政風事項。
第 十 條 本規程所列各職稱之官等職等及員額，另以編制表定之。各職稱之官等職等，依職務列等表之規定。
第十一 條 局長請假或因故不能執行職務，由副局長代理，副局長不能代理時，由主任秘書代理。副局長及主任秘書同時不能代理時，依第四條各款所列單位主管順序代理之。
第十二 條 本局設局務會議，每月舉行一次，必要時得召開臨時會議，以下列人員組成之。
一、局長、副局長。
二、主任秘書。
三、科長。
四、分局主任。
五、主任。
前項會議由局長召集之，開會時並為主席，必要時得由局長邀請或指定其他有關人員列席。
第十三 條 本局之分層負責明細表由本局擬訂，報南投縣政府核定。
第十四 條 本規程自中華民國一百零七年七月十六日施行。
本規程中華民國一百十五年二月五日修正發布之第六條、第十一條及第十二條修正條文，自一百十五年二月一日施行。