1.中華民國八十九年七月二十七日南投縣政府（89）投府法規字第 89114
  327 號令訂定發布全文 12 條；自八十九年一月一日施行            
2.中華民國八十九年十一月一日南投縣政府（89）投府法規字第 8916785
  7 號令修正發布第 4、6、7  條條文
3.中華民國九十四年四月一日南投縣政府（94）府行法字第 09400662720
  號令修正發布第 5、8、12 條條文；並自發布日施行
4.中華民國九十七年五月二十九日南投縣政府府行法字第 09701043210  
  號令修正發布名稱及全文 12 條；並自九十七年一月四日施行（原名稱
  ：南投縣政府原住民行政局組織規程）
5.中華民國106年12月28日府行法字第1060274199號令修正第6條、第7條條文
6.中華民國107年03月14日府行法字第1070061044號令修正編制表